MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal01

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009035	AGA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009035	CATT	2	8	49	56	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009035	TGT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009035	AAG	2	6	170	175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009035	GCA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009035	A	7	7	258	264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009035	AG	3	6	332	337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009035	TG	3	6	1341	1346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009035	CTTATA	2	12	1393	1404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009035	TAACC	2	10	1414	1423	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009035	TCT	2	6	1455	1460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009035	TTA	2	6	1558	1563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009035	TG	3	6	1587	1592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009035	ATA	2	6	2954	2959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009035	CAA	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009035	CTA	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009035	ATT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009035	CTT	2	6	5544	5549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009035	T	6	6	5557	5562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009035	TAAAAG	2	12	5698	5709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009035	TAA	2	6	5710	5715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009035	T	8	8	9004	9011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009035	T	6	6	9052	9057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009035	AGTG	2	8	12937	12944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009035	TGC	2	6	13758	13763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009035	GCA	2	6	13777	13782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009035	AG	3	6	13798	13803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009035	ATG	2	6	13963	13968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009035	AAT	2	6	14969	14974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009035	T	6	6	15004	15009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009035	AAG	2	6	16009	16014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009035	ATT	2	6	16141	16146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009035	CCA	2	6	17688	17693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009035	CAG	2	6	17838	17843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009035	CT	3	6	17919	17924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009035	TCAG	2	8	17998	18005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009035	TGA	2	6	18110	18115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009035	AGGA	2	8	18143	18150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009035	TAA	2	6	19208	19213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009035	TTAT	2	8	20452	20459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009035	CTT	2	6	20497	20502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009035	A	8	8	20534	20541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009035	TA	3	6	20585	20590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009035	TTAT	2	8	20594	20601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009035	CTG	2	6	20622	20627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009035	CG	3	6	20649	20654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009035	A	6	6	20789	20794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009035	T	6	6	20822	20827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009035	CCA	2	6	20901	20906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009035	ACG	2	6	20929	20934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009035	GCA	2	6	21010	21015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009035	TTA	2	6	21050	21055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009035	TCAA	2	8	21223	21230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009035	A	6	6	21239	21244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009035	TCA	2	6	21306	21311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009035	T	6	6	21320	21325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009035	GAT	2	6	21350	21355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009035	TGA	2	6	21500	21505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009035	AAT	2	6	23022	23027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009035	TTG	2	6	23089	23094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009035	TTA	2	6	23126	23131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009035	T	6	6	24090	24095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009035	A	6	6	24111	24116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009035	A	8	8	24138	24145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009035	TAC	2	6	24218	24223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009035	TCAA	2	8	25293	25300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009035	TTA	2	6	25322	25327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009035	AAG	2	6	25395	25400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009035	CATC	2	8	26487	26494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009035	GCAAA	2	10	26552	26561	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009035	A	6	6	26563	26568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009035	CGA	2	6	30476	30481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009035	TA	3	6	30554	30559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009035	GT	3	6	31626	31631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009035	ATC	2	6	31802	31807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009035	GCG	2	6	31808	31813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009035	CAT	2	6	31840	31845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009035	GCTT	2	8	31886	31893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009035	GC	3	6	31896	31901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009035	ACT	2	6	32455	32460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009035	ACAA	2	8	32477	32484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009035	GTTT	2	8	32507	32514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009035	T	7	7	32512	32518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009035	CTG	2	6	32535	32540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009035	A	6	6	34859	34864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009035	ATT	2	6	34941	34946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009035	CGC	2	6	35018	35023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009035	CAG	2	6	35897	35902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009035	GCC	2	6	35928	35933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009035	AT	3	6	35945	35950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009035	TAA	2	6	36523	36528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009035	CGC	2	6	37115	37120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009035	T	7	7	37121	37127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009035	GAA	2	6	38975	38980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009035	T	6	6	39001	39006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009035	T	7	7	39014	39020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009035	TTTGA	2	10	40493	40502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009035	CGA	2	6	40515	40520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009035	A	7	7	40682	40688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009035	TAAA	2	8	42125	42132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009035	GCT	2	6	42198	42203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009035	ATG	2	6	42206	42211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009035	TTGC	2	8	42239	42246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009035	TTGA	2	8	42322	42329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009035	AAT	2	6	42331	42336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009035	CAAA	2	8	42348	42355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009035	CAT	2	6	42366	42371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009035	ACTC	2	8	42389	42396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009035	TAA	2	6	42427	42432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009035	AATA	2	8	42439	42446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009035	ATCA	2	8	42514	42521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009035	CTA	2	6	42551	42556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009035	ACAA	2	8	42568	42575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009035	ATT	2	6	42626	42631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009035	TTC	2	6	42632	42637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009035	A	6	6	42646	42651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009035	TTTA	2	8	42666	42673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009035	A	7	7	42783	42789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009035	TGC	2	6	42801	42806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009035	C	6	6	42808	42813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_009035	TCC	2	6	44174	44179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009035	TTA	2	6	44296	44301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009035	A	6	6	46410	46415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009035	GGT	2	6	46425	46430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009035	T	6	6	46430	46435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009035	TTC	2	6	47111	47116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009035	GAA	2	6	51184	51189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009035	TGT	2	6	51201	51206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009035	AAC	2	6	51212	51217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009035	GTA	2	6	51320	51325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009035	TAC	2	6	51356	51361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009035	GCC	2	6	51379	51384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_009035	CAAAA	2	10	51403	51412	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009035	ATAA	2	8	51413	51420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009035	CATA	2	8	52392	52399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009035	TAC	2	6	52426	52431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009035	T	7	7	52467	52473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009035	CTT	2	6	53944	53949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009035	A	6	6	53982	53987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009035	GGT	2	6	54000	54005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009035	T	6	6	54005	54010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009035	TC	3	6	54078	54083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009035	AGACC	2	10	54142	54151	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_009035	CAC	2	6	57174	57179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_009035	ACA	2	6	57327	57332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009035	AC	3	6	59950	59955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009035	GCGG	2	8	59983	59990	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009035	TAAAA	2	10	60658	60667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009035	A	7	7	60702	60708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_009035	TTTTAG	2	12	113556	113567	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_009035	TAT	2	6	114874	114879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_009035	GGC	2	6	114919	114924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_009035	TA	3	6	114949	114954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_009035	AC	3	6	116648	116653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.